NEM PRIVÁT
Talán még sosem gondolt rá, pedig ez sokakat elriaszt! Sok felhasználó számára már ez önmagában elég érv, hogy ne használjanak online számlázó programot! A szolgáltató bármikor beleláthat az Ön adataiba és saját célra is felhasználhatja azt. Például az online számlázó programot fejlesztő ismerősének olyan érdekeltségi körű vállalkozása van, mint Önnek, akkor meg tudja szerezni az Ön ügyfeleit és mindent lát naprakészen, hogy Ön kinek ad el, mikor, mennyit, milyen áron, mekkora az árbevétele és a haszna, de a szolgáltató megnézheti azt is, hogy melyik felhasználónak van a legnagyobb árbevétele, legtöbb számlája, sikeres cége és annak alapján ő vagy ismerőse belevághat egy hasonló üzletbe és mivel mindent látni fognak az Ön üzletéről, Ön mindig lépéshátrányban lesz.

NEM BIZTONSÁGOS
Fogalmazhatnánk úgyis, hogy valódi hacker-mágnes. Igen kívánatos célpontjai a hackereknek ezek a szolgáltatók, hiszen központilag több ezer felhasználó adata, számlái tárolódnak egy helyen. Egy sikeres támadással minden adatot el tudnak lopni, rosszabb esetben pedig az Ön nevében állítanak ki fiktív számlákat, vagy mintegy trójai támadásként egyszerűen megmásítják a letárolt adatokat, így az nem fog rögtön feltűnni senkinek, majd csak hetekkel, hónapokkal később, esetleg pont egy NAV ellenőrzésnél.

NINCS TELEFONOS ÜGYFÉLSZOLGÁLAT
Az online számlázás kitalálói általában éppen abban akarnak nagyot alkotni, hogy minden online, így nem preferálják az olyan hagyományos kommunikációs formákat, mint a telefonos ügyfélszolgálat vagy a személyes szoftvervásárlás. Jobb esetben egy e-mail címre írhat egy levelet és majd valamikor válaszolnak a kérdésére. Mivel más felhasználók is csak írni tudnak, így általában a válaszidő a sok levél miatt több nap is lehet.

NEHÉZKESEN KEZELHETŐ
Az online számlázó programot csak internetböngészőből tudja futtatni, ugyanakkor a böngészőket weblapok nézegetéséhez találták ki, nem pedig alkalmazások futtatására, így általában ezért nem ergonómikus a kezelőfelületük és nehézkesen, lassan kezelhetők.

DURVA, ONLINE KORLÁTOZÁSOK
Főként az online / felhő alapú számlázó programok trükkje, hogy ha lejár az előfizetése, de nem hosszabbítja meg azt, akkor el sem tudja indítani a számlázó programot vagy elérhetetlenek lesznek benne a korábbi bizonylatok, menüpontok.

INTERNET KELL HOZZÁ
Akkor, ha Önnek nincs internete, egyszerűen nem tudja használni a programot, sem számlázni nem tud (milyen kellemetlen, ha ott áll szemben a vevő és nem tud számlát adni neki, mert elment az internet), de még egy sima nyilvántartást sem tud megnyitni. Abban az esetben pedig, ha épp karbantartja a honlapot a szolgáltató, az összes felhasználónál egyszerre megáll a rendszer. Azt már említenünk sem kell, hogy az interneten keresztül lehet elkapni a legtöbb vírust. Nem véletlen, hogy ma már sok elővigyázatos felhasználó nem, hogy nem használ online számlázó programot, hanem a gépre telepített számlázót is csak olyan gépen futtatja, ahol nincs internet.

LASSÚ
...mert az internet egyelőre még nem olyan gyors, mint egy helyi hálózat. Másrészt képzelje el, hogy másik több ezer felhasználóval ugyanabban a rendszerbe dolgozik, ugyanazon a szerveren egyidejűleg, emiatt meg sem közelíti a felhő alapú számlázó program teljesítménye az asztali programok teljesítményét.

Felmerül a kérdés, hogy ha ilyen sok hátránya van a felhő alapú számlázóknak, akkor létezik-e egyáltalán bármi előnyük? Igazából kevés, illetve ami van, az egyben a hátrányuk is...

NEM KELL TELEPÍTENI
Ez akár előnyként is elmondható, viszont a telepíthető szoftvereknek másik oldalról ez nem hátránya az online termékekkel szemben, hiszen mindenki telepített már szoftvert gépére vagy alkalmazást a telefonjára, ami a legtöbb esetben nem mondható bonyolultnak, ráadásul csak egyszer kell megtenni.

MINDENHONNAN MŰKÖDIK
Igen, de ez egyben a hátránya is! Bárki be tud lépni a világ bármely pontján az online számlázó programba, ha hozzájut a kódunkhoz vagy feltöri gépünket, illetve az egész rendszert. Például, Ön a nyaralás alatt a szálloda WiFi hálózatához kapcsolódik, ami fertőzött vagy kiszáll az egyik ügyféléhez és az ő fertőzött WiFi hálózatán keresztül lép be az online számlázó programba a számla kiállításához és már ott is a baj. Ma már nem kell felhő alapú számlázó program ahhoz, hogy bárhonnan számlázzon, mert az internet sebessége lehetővé teszi, hogy VPN kapcsolaton keresztül tökéletesen és biztonságosan(!) futtasson egy hagyományos számlázó programot hálózatosan.

PLATFORMFÜGGETLEN
Ez annyit jelent, hogy nem csak Windows operációs rendszereken, hanem Linuxon és Apple/Macintosh gépeken is futtatható, azonban valljuk be, ez igen ritka az üzleti szférában, illetve ma már Windows-os programot is lehet Linux és Apple/Macintosh rendszereken futtatni emulátoron keresztül.

MINDIG VAN MENTÉS
...csak elvileg, mivel az online számlázás esetén Ön nem tud gondoskodni az adatai mentéséről, mert azért a szolgáltató a felelős, viszont így teljes mértékben ki van szolgáltatva a szolgáltatónak. A szolgáltató hiába hitegeti Önt, egy nagy vihar, tűzkár, földrengés, vagy akár a szolgáltató hanyagságából így is előfordulhat, hogy elveszhetnek az adatai és Ön nem tud ellene védekezni, maximum reklamálni vagy kártérítést kérni, de az adatai nem lesznek meg.